医学家提出,从生物多样性上来说,克隆将减少遗传变异,提高了疾病传染的风险。通过克隆产生的个体具有同样的遗传基因,同样的疾病敏感性,一种疾病就可以毁灭整个由克隆产生的群体,这对人类的生存是不利的。克隆技术的使用将使人们倾向于大量繁殖现有种群中最有利用价值的个体,而不是按自然规律促进整个种群的优胜劣汰,散芹从而干扰了自然进化过程。
社会学家一致强调,从社会的角度看,作为社会主体的人类是不能随意制造的,否则生命将不会受到尊重,而且可能随意毁坏生命。况且,克隆人与真实的人完全不同,基因编码可以复制,但真实的人格和情感无法克隆。克隆会使人的不可重复性和不可替代性的个性规定,因大量复制而丧失了唯一性,丧失了自搏纳我及其个性特征的自然基础和生物学前提。
伦理学家尤其强烈地反对克隆人工程,他们认为克隆人还将对现有的社会关系、家庭结构造成巨大冲击。另外,克隆人的身份难以认定,使人伦关系发生模糊、混乱乃至颠倒,进而冲击传统的家庭观以及权利与义务观。克隆人还可能因自己的特殊身份而产生心理缺陷,形成新的社会问题。
现今支持克隆人的一个观点是,克隆人可以解决无法生育的问题。但也有反对者马上提出:一个没有生育能力的人,克隆的下一代还会没有生育能力。被克隆的人虽然很优秀,但克隆出的人除血型、相貌、指纹、基因和本人一样外,其性格、行为可能完全不同。在克隆人研究中,如果出现异常,有缺陷的克隆人不能像克隆的动物一样被随意处理掉,这也基掘没是一个问题。因此在目前的环境下,不仅是观念、制度,包括整个社会结构都不知道怎么来接纳克隆人。尽管如此,克隆技术的巨大理论意义和实用价值还一直促使科学家们加快研究的步伐——克隆技术犹如原子能技术,是一把双刃剑,而剑柄掌握在人类手中。